Basado en el famoso manga Ghost in the Shell, un thriller futurista que narra las misiones de Matoko Kusanag, cuenta como esta mujer es la encargada de las operaciones encubiertas de una sección de la policía especializada en crímenes tecnológicos. Kusanagi, gracias a ser un cíborg, puede conseguir gestas sobrehumanas. Ahora, esta joven mujer indaga en el verdadero significado de la conciencia humana. La nueva serie de animación en 3D, nos lleva hasta el año 2045, donde nos recoloca en la era en la que el capitalismo global ha colapsado y el mundo esta arrasado, tras la caída del capitalismo y las principales economías globales. Será en este momento donde la llamada Sección 9 empieza a desarrollar misiones secretas con un claro objetivo: descubrir todo lo que se encuentra detrás.

Ambientada en el año 2032 DC. La verdad se revela a través de la aparición de la Oficina de Inteligencia e Investigación del Gabinete, que es hostil a la Sección 9 desde el fondo de la resurrección de la Sección 9 de Seguridad Pública, a partir del caso de un terrorista que dice ser "11 personas individuales", y la aparición del caso individual de 11 personas y Kuze. Se convierte en. La manipulación de la información y las actividades de elaboración de la Oficina de Inteligencia e Investigación del Gabinete aumentarán la desconfianza y la oposición de los refugiados, y los refugiados de consolación se armarán y se sublevarán a la vez.

En el año 2030, las redes digitales llegan a todas partes, y la tecnología que empuja la luz y los electrones ha avanzado hasta un estado en el que casi impulsa la voluntad humana... Las redes de información siguen expandiéndose y los delitos siguen siendo más complejos. En esta sociedad al borde del caos, se creó una organización especializada en la caza y eliminación del crimen. Se trata de la Sección 9, el llamado "Complejo Autónomo" (S.A.C.), bajo la supervisión directa del Ministerio del Interior. Sus funciones incluyen una amplia gama de investigaciones, como responder a delitos cibernéticos críticos, vigilar a personalidades del país, revelar la corrupción política, investigar asesinatos violentos y ocuparse de casos de asesinatos de alto secreto. El S.A.C. de élite da lo mejor de sí en los enfrentamientos cibernéticos, pero también es extremadamente capaz de enfrentarse físicamente utilizando ciborgs de alta calidad

La historia tiene lugar en Tokio en 2018, donde conviven humanos normales y aquellos que pueden usar la magia. Como resultado, existen leyes contra el uso de la magia y existe una "sala de audiencias mágicas" para presidir las demandas relacionadas con el uso de la magia. En estos casos, "Benmashi" o abogados magos defienden a los que usan magia. El anime sigue a Cecil, la Benmashi más joven de la historia, y sus asociados mientras defienden a los clientes en estos casos.