La película narra las aventuras de nueve personas que son secuestradas por la organización Black Ghost y obligadas a convertirse en cyborgs. El conflicto llegará cuando los nueve inocentes se escapen con el fin de desbaratar los planes de sus viejos captores, los cuales pretenden conducir a la humanidad a una Tercera Guerra Mundial mediante la venta de armas súper destructivas. '009 Re: Cyborg' pertenece a la productora Production I.G., responsable de los éxitos de manga 'Ghost in the shell' o 'GITS Stand alone complex'. Además, ha sido capaz de conseguir un resultado espectacular al combinar la animación en 3D, la apariencia del anime clásico y unos efectos CGI de última generación.