El bullicioso estudiante Kaname Chidori y el soldado Sousuke Sagara disfrutan de una feliz vida en el instituto. Sin embargo, sus apacibles días se ven interrumpidos por la amenazante organización terrorista Amalgam. Leonard Testarossa, un miembro de la organización que posee "Whispered", pretende hacerse con Kaname y sus conocimientos. La batalla de Kaname y Sousuke contra Amalgam comienza justo en su propio barrio, lo que finalmente les lleva a una cacería por todo el mundo. Desde las exóticas tierras de Laos hasta la árida costa mexicana, Sousuke debe reunir información para acabar con Amalgam.