Hibiki Tachibana ha derrotado a muchos enemigos poderosos, ha salvado innumerables vidas inocentes y ha escapado de numerosas situaciones desesperadas, pero actualmente se encuentra con que no puede escapar de su situación más desesperada: ¡los deberes del verano! Aunque su vida en el instituto es relativamente anodina, su carrera como miembro de la organización militar S.O.N.G. es todo lo contrario. Utilizando una poderosa y antigua armadura conocida como Symphogear, Hibiki y sus compañeros de equipo trabajan con las Naciones Unidas para resolver disputas y desastres internacionales.

Durante una reunión informativa en el cuartel general, Hibiki se entera de la existencia de una misteriosa organización conocida como los Illuminati de Baviera, que ha sido responsable de varias catástrofes importantes en el pasado y que actualmente opera en el país devastado por la guerra, Val Verde. Juntos, Hibiki y su equipo se infiltran en una de las plantas de fabricación de los Illuminati bávaros y liberan a cientos de esclavos. Al ser descubiertos, los alquimistas Saint-Germain, Cagliostro y Prelati se revelan como la cúpula de la organización y, haciendo uso de sus poderes alquímicos, declaran una revolución mundial mientras sacrifican miles de vidas. Enfrentados a una nueva amenaza para la supervivencia del mundo, Hibiki y sus aliados deben enfrentarse a los Illuminati de Baviera en su batalla más difícil y destructiva.