Con el Campeonato Interhigh finalmente terminado, el equipo de baloncesto de Seirin vuelve a centrar sus esfuerzos, entrenando más duro que nunca para tener la oportunidad de participar en la Copa de Invierno. Tanto Kuroko como Kagami ven cómo viejos amigos vuelven a entrar en sus vidas, proporcionando un desafío tanto dentro como fuera de la cancha.

A medida que se desarrollan nuevas habilidades y se crean nuevas alianzas, los enemigos de varios equipos -gigantes del baloncesto de instituto como Yousen, Shuutoku y Touou- se interponen en los firmes intentos de Seirin por llegar a la cima. Todas estas escuelas resultan ser enemigos formidables cuyas habilidades progresan exponencialmente, mientras Kuroko lucha por encontrar un equilibrio entre su determinación de jugar como parte de un equipo y su deseo de ganar.

Con viejas heridas que se reabren, nuevos retos a los que enfrentarse en la cancha y un nuevo grupo de enemigos -los "Reyes sin corona"- que juran derrotar a los nuevos aspirantes, ¿podrá Seirin alcanzar su sueño de vencer a la Generación de los Milagros?