En la escuela secundaria Tsutsujidai en Tokio, dos vidas comunes se entrelazan para crear algo extraordinario. Hibiki Yuta, un estudiante de segundo año, dibuja y borra a Gridman en su cuaderno, luchando por recordar algo importante. Este mundo fue creado y destruido una vez por una niña, pero fue salvado por Gridman, un hiperagente de otra dimensión, junto a Yuta y sus amigos.
Ahora, en una clase diferente a la de Rikka, Yuta decide confesar sus sentimientos por ella. Sin embargo, su pacífica vida escolar comienza a desmoronarse con un rugido. En medio de la crisis, Gridman le advierte que el equilibrio del mundo está en peligro. Pronto, el dragón rojo Dynalex y otros aliados de Gridman, así como estudiantes y residentes de otros mundos, aparecen frente a Yuta. Mientras mantiene en secreto sus sentimientos por Rikka, la vida de Yuta se vuelve cada vez más extraordinaria.