La historia comienza cuando Berry, una chica normal de un hogar normal, conoce a Hack, una chica que parece un chico. Encantada por Hack, Berry se reúne con el equipo que dirige Hack, el Club de Detectives Fantasma. Los miembros de este club están "socialmente muertos" y trabajan de forma invisible en la sociedad digitalmente controlada de Tom Sawyer. Mientras trabaja con el grupo, Berry se entera de la existencia de Zero, una misteriosa figura que acecha en el subsuelo de Tom Sawyer. Ella y Hack deciden perseguir a esta figura, y con el tiempo, la verdad detrás de la ciudad se revela.