Basada en la novela "La increible ola" de Alexander Key, Mirai Shonen Conan nos lleva a vivir las aventuras de Conan, un joven que vive en una epóca post-apocalíptica donde la gran parte de la tierra ha sido invadida de nuevo por los oceanos. Tras conocer a Lana, una joven perseguida por el ejercito de la Isla de Industria, Conan comenzará una aventura para liberar al mundo del malvado coronel Lepka. El esquema de la serie es el característico de los trabajos de Miyazaki: situaciones crudas y personajes egoistas e interesados a la par que compresivos todo ello enfocado desde la inocencia.