La Clase 1-A de la Academia UA ha sido el foco de una cantidad sustancial de atención pública debido a los múltiples ataques de villanos que han enfrentado durante el último año escolar. Esta atención ha dejado a los rivales de la Clase 1-A, la Clase 1-B, sintiéndose bastante amargados. Deseando demostrar sus habilidades, esperan la oportunidad que se les ha brindado: una serie de simulacros de batallas entre los estudiantes de cada clase. Las clases se dividen en escuadrones de cuatro, cada uno de los cuales tiene la tarea de capturar a los otros miembros del grupo. El ganador es el grupo que primero asegura a todo el equipo contrario. Si bien esto suena simple, se agrega una bola curva a la mezcla con la inclusión del estudiante del curso general Hitoshi Shinsou, quien desea transferirse al curso de héroe. A pesar de usar su entrenamiento con el maestro de salón de clase 1-A, Shouta “Eraserhead” Aizawa para demostrar que es capaz de ser un verdadero héroe, todavía está muy por detrás de los demás debido a su falta de experiencia. Sin embargo, Shinsou está decidido a superar este desafío. Así comienza la feroz competencia entre las clases 1-A y 1-B, ya que cada una intenta demostrar que es superior a la otra.

Haruhi es una estudiante de clase media-baja que, gracias a una beca, asiste a una prestigiosa escuela destinada a los hijos de familias ricas y poderosas. Incapaz de costear el uniforme oficial de la institución, cuyo precio asciende a 300,000 yenes, Haruhi lleva una vida discreta hasta que, por casualidad, se cruza con el **Ouran Host Club**.
En un intento por retirarse rápidamente, accidentalmente rompe un valioso jarrón valorado en 8 millones de yenes. Para pagar la deuda, el club le obliga a trabajar para ellos. Sin embargo, pronto descubren que Haruhi tiene un carisma único y deciden convertirla en miembro oficial. Confundidos por su apariencia andrógina, le entregan un uniforme masculino, y su popularidad entre las clientas crece de inmediato. Incluso cuando descubren su verdadera identidad, el club opta por mantener la farsa, desatando situaciones tan divertidas como inesperadas.

Atsushi Nakajima, un joven de 18 años, es expulsado del orfanato donde vivía debido a un tigre místico que solo él puede ver. Sin hogar y hambriento, salva a Osamu Dazai, un detective sobrenatural, de ahogarse en un río. Dazai y su compañero Doppo Kunikida están investigando al mismo tigre. Juntos resuelven el misterio, pero Atsushi se ve obligado a unirse a su agencia de detectives sobrenaturales, enfrentándose a casos que la policía no puede resolver.