La escuela femenina Uranohoshi, en la ciudad de Numazu, Shizuoka, es una pequeña escuela al borde del cierre debido a la falta de solicitudes de nuevos alumnos que quieran inscribirse en ella. La escuela lleva un tiempo pensando en fusionarse con otra y desaparecer, pero un grupo de alumnas no está dispuesta a ceder sin luchar por conservar su espacio y deciden ayudar a popularizarla para atraer nuevos estudiantes. ¿La idea? ¡Crear un grupo de idols? Así crearán un grupo con el que aspirarán a lo más alto y a salvar la escuela.

El Prodigio del piano, Arima Kosei dominó la competencia y todos los niños músicos sabían su nombre. Pero luego de que su madre, que a la vez era su instructora, muriera, él tuvo un colapso mental mientras tocaba en un recital que resultó en la incapacidad de poder escuchar el sonido de su piano otra vez, aun cuando no tenía problema alguno de audición. Incluso después de dos años, Kosei no ha tocado el piano y ve al mundo monótono, sin colores. Él estaba contento de vivir su vida con sus amigos Tsubaki y Watari hasta que, un día, una chica lo cambió todo. Miyazono Kaori es una linda violinista sin remordimientos cuyo estilo para tocar el violín refleja su personalidad. Kaori ayuda a Kosei a volver al mundo de la música, y le muestra que debería ser libre y romper los esquemas a diferencia del estructurado y rígido estilo al que Kosei estaba acostumbrado.

El instituto Otonokizaka se ha salvado! A pesar de tener que retirarse del Love Live!, los esfuerzos se lograron reunir el suficiente interés en su escuela como para evitar su cierre. Es más, tras la conclusión del primero, se anuncia un segundo Love Live!, esta vez en un escenario aún mayor que el anterior. Con la oportunidad de redimirse, las nueve chicas se reúnen una vez más para cantar con el corazón y reclamar la victoria. Sin embargo, al acercarse el final del año escolar, se acerca la graduación de los terceros años. Mientras intentan llegar a la cima del Love Live!, también deben considerar su futuro y elegir qué camino tomará el grupo. Aunque la cuestión de si continuar sin los terceros años o disolverse pesa mucho en la mente de sus miembros, los μ's deben llegar rápidamente a una respuesta con la graduación a la vuelta de la esquina. Love Live! School Idol Project 2 temporada continúa la historia de las chicas mientras ríen, lloran, cantan y bailan en su viaje para determinar el futuro de su grupo y conquistar el Love Live! en su última oportunidad de ganar con las nueve chicas juntas.

Centrada en la Preparatoria Otonokizaka, la cual esta en riesgo de cerrarse debido al numero reducido de estudiantes. Para evitarlo, nueve chicas se volveran idols para promocionar su escuela.