Emma, Ray y el resto de los niños mayores han escapado de los confines de la Casa de Campo de Grace. Sin embargo, con los implacables demonios empeñados en capturarlos, su ardua batalla por la libertad no ha hecho más que empezar.

A pesar de aventurarse en el traicionero desierto, los niños siguen siendo optimistas gracias a la posesión de libros escritos por William Minerva. En sus libros hay mensajes que describen el mundo fuera de la granja, información que puede ayudarles a sobrevivir con los limitados recursos de que disponen. Pero cuando sus perseguidores se acercan, los niños no tardan en encontrarse con su situación más terrible.

En la segunda temporada de Yakusoku no Neverland, los niños luchan por sobrevivir en un mundo extraño y despiadado, esforzándose por encontrar un santuario al que puedan llamar hogar.