Un evento de desaparición masiva global tiene lugar entre la humanidad. Rena y Shinjirou desaparecen simultáneamente. A raíz de estos acontecimientos, el periodista independiente Kotaro Higashi investiga este misterioso "incidente de desaparición".

Los alienígenas que están detrás son la organización terrorista Dark Star. Transmiten un mensaje a los habitantes de la Tierra. "Dadnos la mitad de la Tierra o sacrificad a la mitad de su gente... elegid". Al mismo tiempo, los recientemente desaparecidos Rena y Shinjirou son teletransportados a la nave de Dark Star que orbita la Tierra.

Al enterarse de demasiado, Koutarou queda atrapado en el fuego cruzado entre Dark Star y el SSSP, y casi queda muerto.... En la batalla final, nuestros héroes se enfrentan off contra la Fortaleza Dorada. Frente a este mecha gigante que destruye la ciudad, a ULTRAMAN, SEVEN y TARO se les unen ZOFFY, JACK y ACE. ¡Por fin se han reunido los 6 héroes de ULTRAMAN