En la tercera temporada de Shingeki no Kyojin, Eren y sus compañeros no sólo luchan por su supervivencia contra los terroríficos Titanes, sino también contra el terror de un enemigo mucho más intrigante: los humanos,
Todavía amenazada por los "Titanes" que les roban su libertad, la humanidad permanece enjaulada dentro de los dos muros que quedan. Los esfuerzos por erradicar a estos monstruos continúan; sin embargo, las amenazas surgen no sólo de los Titanes más allá de los muros, sino también de los humanos dentro de ellos.

Tras ser rescatado de los Titanes Colosales y Blindados, Eren Yaeger se dedica a mejorar su forma de Titán. Krista Lenz lucha por aceptar la pérdida de su amigo, el capitán Levi elige a Eren y a sus amigos para formar su nuevo escuadrón personal, y el comandante Erwin Smith se recupera de sus heridas. Todo parece ir bien para los soldados, hasta que el gobierno exige repentinamente la custodia de Eren y Krista. Los recientes éxitos del Survey Corps han llamado la atención, y una cara familiar del pasado de Levi es enviada a recoger a los soldados buscados. Perseguidos por el gobierno, Levi y su nuevo escuadrón deben evadir a sus adversarios con la esperanza de mantener a Eren y Krista a salvo.