Tras su triunfo contra el instituto Yousen, el equipo de baloncesto de Seirin ha llegado a las semifinales de la Copa de Invierno junto con Kaijou, Rakuzan y Shuutoku. Cada uno de estos equipos cuenta con un miembro de la Generación de los Milagros, y Seirin se prepara para enfrentarse a los mayores obstáculos en su camino para ganar la Copa de Invierno.

En la última temporada de Kuroko no Basket, Kuroko se enfrenta una vez más a sus antiguos compañeros de equipo mientras intenta demostrarles que la habilidad individual no es la única forma de jugar al baloncesto. Su firme creencia de que su forma de baloncesto, el juego en equipo, es la manera correcta de practicar el deporte chocará con el talento de una copia perfecta y una autoridad absoluta.

Mientras Kuroko intenta demostrar que su baloncesto es el "correcto", él y el resto del instituto Seirin tienen en última instancia un objetivo: ganar la Copa de Invierno y superar la fuerza de la Generación de los Milagros, que lleva mucho tiempo dominando la escena del baloncesto de secundaria y preparatoria.