Diez años después de la desaparición de Ryoma Nagare, Go Ichimonji y Messiah Tyr en Marte, el Instituto Saotome está ahora bajo el mando de Hayato Jin para entrenar a nuevos pilotos para proteger la Tierra contra amenazas extraterrestres tanto dentro como fuera del planeta. De estos individuos estaban Takuma Nagare, el hijo de Ryoma; Sho Kamui, un híbrido humano-dinosaurio; y Baku Yamagishi, hermano menor del Mesías Tyr. A raíz de las invasiones entre los restos del Imperio de los Dinosaurios y el enjambre de alienígenas tecnoorgánicos con apariencia de insectos del Andromeda Flow Country, el nuevo Equipo Getter debe trabajar en conjunto para derrotar las amenazas que se avecinan y usar la nueva máquina del Instituto Saotome: El Getter Robo Arc protegerá a la humanidad de su propia extinción.