Cuenta la historia de Yuzu Hieda, una estudiante de primer año de instituto y una de las tres hermanas, todas ellas miko del santuario sintoísta local. Cuando su amor de la infancia regresa, se descubre que los dioses oscuros tienen un gran interés en él y Yuzu es reclutada para reunir a sus compañeras en un "Consejo de Miko" para luchar contra un asalto místico a gran escala. Las sacerdotisas tienen talismanes que concentran sus poderes y que se utilizan para atacar a los kami oscuros.