Unos misteriosos humanos inmortales conocidos como "Ajin" aparecieron por primera vez hace 17 años en África. Tras su descubrimiento, se les calificó como una amenaza para la humanidad, ya que podrían utilizar sus poderes para el mal y eran incapaces de ser destruidos. Desde entonces, cada vez que se encuentra un Ajin en la sociedad, debe ser arrestado y puesto bajo custodia inmediatamente.

Kei Nagai, que estudia mucho para convertirse en médico, es un estudiante de secundaria que sabe muy poco sobre los Ajin, sólo los ha visto aparecer en las noticias de vez en cuando. A los estudiantes se les enseña que estas criaturas no se consideran humanas, pero Kei no presta mucha atención en clase. Como resultado, su escaso conocimiento de este tema resulta ser completamente irrelevante cuando sobrevive a un accidente que supuestamente iba a cobrarse su vida, lo que supone su renacimiento como Ajin y el comienzo de sus días de tormento. Sin embargo, al encontrarse solo y huyendo de todo el mundo, Kei pronto se da cuenta de que más de su especie puede estar mucho más cerca de lo que piensa.