Corre el año 2207 d.C. Han pasado dos años desde la aniquilación de Gamilas e Iscandar. De repente, un misterioso objeto gigante, el «Gran Reverso», aparece en el sistema solar. A pesar de los esfuerzos de las Fuerzas de Defensa de la Tierra, el «Gran Reverso» atraviesa fácilmente las múltiples capas de defensas y desciende hacia la nueva capital de la Tierra sin vacilar. Enjambres de soldados descendentes aparecen sin hacer ruido. Tanques de varias patas aterrizan. En un abrir y cerrar de ojos, la capital está invadida. ¿No hay forma de que la Tierra resista? En ese momento, la tripulación de la vieja flota Yamato recibe una orden ultrasecreta. «¡Reúnanse en Yamato!»