Readaptación de la serie manga principal, Himura Kenshin es un vagabundo con un pasado oscuro y una disposición soleada. No un ronin sino un rurouni, nunca fue un samurái, sino un asesino de gran habilidad en la restauración Meiji, que en el punto de inflexión de la guerra simplemente se alejó. Sus viajes lo llevan a Tokio en el año 11 de la era Meiji, donde se hace amigo de una maestra de Kendo, una ex ladrona, una camorrista y una doctora, todas con sus propios secretos. Juntos luchan contra los enemigos que emergen del oscuro pasado del que Kenshin no puede escapar.