El equipo de baloncesto de la Escuela Secundaria Teikou es coronado campeón durante tres años consecutivos gracias a cinco jugadores destacados que, con sus habilidades asombrosas y únicas, dejan a los oponentes desesperados y a los fanáticos admirados. Sin embargo, después de graduarse, estos compañeros de equipo, conocidos como "La Generación de los Milagros", siguen caminos separados y ahora se consideran rivales. En la Escuela Secundaria Seirin, dos nuevos reclutas demuestran que no son jugadores de baloncesto ordinarios: Taiga Kagami, un jugador prometedor que regresa de los Estados Unidos, y Tetsuya Kuroko, un estudiante aparentemente común cuya falta de presencia le permite moverse desapercibido. Aunque Kuroko no es atlético ni capaz de anotar puntos, fue miembro del equipo de baloncesto de Teikou, donde jugó como el "Sexto Hombre Fantasma", que pasaba el balón fácilmente y ayudaba a sus compañeros de equipo. Kuroko no Basket sigue el viaje de los jugadores de Seirin mientras intentan convertirse en el mejor equipo de secundaria de Japón al ganar el Campeonato Interhigh. Para alcanzar su objetivo, deben cruzarse con varios equipos poderosos, algunos de los cuales tienen uno de los cinco jugadores con habilidades divinas, a quienes Kuroko y Taiga hacen un pacto para derrotar.