Al concluir el Koshien de la Escuela Secundaria Vanguardia, Kouji Ibuki comienza a tener nuevas pesadillas. Nome Tatsunagi hace que Suiko lo convoque a la mansión donde se enteran de que puede ver una Torre Oscura llamada Santuario. Sanctuary está provocando que la línea de tiempo se altere a lo largo de la historia, y la única manera de corregirlo es que Kouji corrija primero su error del futuro. Ahora Kouji y Suiko deben viajar por el mundo paralelo -si- y ver como las Magical Girls Emi Sendou y Shuka convocan a las unidades de Vanguardia para ayudar a corregir la historia. Lamentablemente, las dos no pueden ayudar mucho, ya que el Cardfighting contra monstruos reales no sirve de mucho.