"El Tigre Blanco y la Bestia Negra" sigue la lucha de Nakajima Atsushi y Akutagawa Ryunosuke contra Francis F., poniendo fin a la gran guerra con el Gremio. La vida en Yokohama regresa a la normalidad gracias a la tregua entre la Agencia de Detectives Armados y la Mafia del Puerto, quienes salvaron la ciudad. Sin embargo, aún hay rumores de miembros del Gremio y otras organizaciones criminales que vienen del extranjero. Mientras tanto, Dazai Osamu tiene premoniciones de un nuevo desastre inminente, y en la oscuridad acecha Fyodor D., líder de los piratas Ratas en la Casa de los Muertos.