Tras escapar de una muerte segura, Kei Nagai y su nuevo compañero Kou Nakano planean vengarse de Satou, su compañero Ajin que está empeñado en dominar el mundo. Mientras Satou se embarca en una serie de ejecuciones públicas, la raza humana se apresura a encontrar una solución para detener al villano inmortal. Kei descubre unos aliados improbables en la forma de dos antiguos adversarios: el alto funcionario del gobierno Yuu Tosaki, cuya extensa investigación sobre los Ajin le da una ventaja táctica en la lucha contra Satou, y la asistente de Tosaki en los Ajin, Izumi Shimomura. Mientras su facción sigue reuniendo aliados, Kei corre contrarreloj para poner fin a la cruzada de Satou antes de que provoque el fin de la civilización tal y como la conoce.