Shinobou es un aprendiz de ninja. Para demostrar su talento y convertirse en una verdadera ninja, ¡tiene que robar toda la ropa interior de las chicas en la escuela secundaria! La primera víctima es Kaede Shiranui, quien sorprende a Shinobou en vuelo. Kaede, por compasión hacia Shinobou, le ofrecerá sus bragas, para que esta última no falle su examen de ninja. Las dos chicas se harán amigas rápidamente, a pesar de Onsokumaru, el autoproclamado maestro ninja bola voladora amarilla que intenta interferir en la amistad de estas dos jóvenes.