Rentarō Aijo fue rechazado 100 veces en la secundaria. Visita un santuario y reza por mejor suerte en la preparatoria. El Dios del Amor aparece y promete que pronto conocerá a 100 personas con las que está destinado a salir. Pero hay una trampa: una vez que el destino los presenta, los dos deben amarse felices. Si no lo hacen, morirán. ¿Qué les deparará a Rentarō y a sus 100 novias en la preparatoria?

La historia sigue a Kuroi Mato, una joven universitaria que busca conectar con Yomi Takanashi, una de sus compañeras de clase que, por desgracia, parece bastante cerrada a los demás. Un día, la joven tiene la oportunidad de visitar a su amiga y aprovecha para compartir con ella su libro ilustrado favorito. Es también en casa de Yomi donde Kuroi conoce a Kagari Izuriha, una joven en silla de ruedas que no es otra que la mejor amiga de Yomi. Lo que Kuroi no sabe es que existe un mundo paralelo al suyo, en el que vive el alter ego de cada ser humano, y en el que se libra una guerra incesante desde hace mucho tiempo. En este mundo, su propio alter ego se llama Black Rock Shooter, una joven con un ojo en el que arde una misteriosa llama azul... ¿Existe un vínculo entre los habitantes de estos dos mundos