Shoma Mihara es un estudiante que ha perdido el contacto con su mejor amigo tras 3 años separados. Un día recibe una invitación para reencontrarse con él en un festival, y Shoma acepta. Al llegar allí, se encuentra en su lugar con Shiori, una chica que también se suponía que se encontraría con otra persona durante el festival.

Estamos a principios del siglo XXI. La humanidad ha perdido la batalla por el planeta Tierra ante Godzilla, y ha salido a las estrellas en busca de un nuevo hogar. Pero la búsqueda termina en vano, obligándoles a ellos y a sus aliados alienígenas a volver a la Tierra. Pero han pasado 20.000 años en su ausencia, y la Tierra es un lugar totalmente diferente. La flora y la fauna del planeta ahora encarnan y sirven a Godzilla. La Tierra es un planeta de monstruos, gobernado por el Godzilla más grande de la historia, con 300 metros de altura. Godzilla Tierra. El protagonista humano, el capitán Haruo, anhela derrotar a Godzilla y recuperar el planeta para la humanidad. Allí conoce a los descendientes aborígenes de la raza humana, la tribu Houtua. Las hermanas gemelas Houtua, Maina y Miana, le conducen hasta los restos esqueléticos de Mecha-Godzilla, una antigua arma anti-Godzilla, que para sorpresa de todos sigue viva en forma de nanometal autogenerador. Extraídos del cadáver de Mecha-Godzilla, los nanometales han ido reconstruyendo poco a poco una "Ciudad Mecha-Godzilla", un arma potencial capaz de destruir la Tierra de Godzilla.

Siguiendo los acontecimientos de los episodios de List of The Melancholy of Haruhi Suzumiya, la historia tiene lugar desde el 16 de diciembre hasta el 24 de diciembre, un mes después del Festival Cultural Japonés. La Brigada SOS, liderada por Haruhi Suzumiya (personaje), hace planes para celebrar una fiesta nabemono en Navidad. Sin embargo, en la mañana del 18 de diciembre, Kyon llega a la escuela y descubre que la propia naturaleza de su realidad ha cambiado; Haruhi e Itsuki Koizumi han desaparecido, Ryoko Asakura ha regresado misteriosamente, Mikuru Asahina no le reconoce y Yuki Nagato es una humana corriente. Sólo Kyon es consciente de que todo es diferente y nadie más recuerda nada sobre Haruhi o la Brigada SOS. La única pista que Kyon consigue encontrar es un marcador dejado por la versión alienígena de Yuki antes de que todo cambiara, en el que se le dice que reúna "llaves" para ejecutar un programa. Mientras se pregunta por esta pista, llega a conocer a la nueva Yuki, que parece estar bastante encariñada con él. Al llegar el 20 de diciembre, Kyon se entera por List of Haruhi Suzumiya characters#Taniguchi de que Haruhi estuvo todo el tiempo en otro instituto, junto con Itsuki y otros antiguos alumnos de su escuela. Al revelarle su identidad como "John Smith", un alias que había utilizado cuando viajó al pasado para ayudar a una joven Haruhi, Kyon consigue convencer a Haruhi de que crea su historia. Con su ayuda, reúnen a la Brigada SOS en la sala del club, trayendo así las claves necesarias para un programa construido por la alienígena Yuki.

Los OVAs de Seto no Hanayome son nuevos cortos independientes con personajes de la serie y también dos nuevos. Es el tercer año de la escuela, los padres de San y Luna siguen siendo demasiado protectores. Mientras tanto, Nagasumi está muy ocupado tratando de mantener a todos los que le rodean bajo control y rescatando a las damiselas en apuros.